科学研究

良渚学科交叉论坛 | 第三代长读长测序技术的前沿优势及应用

发布日期:2023-12-05 点击次数:

近日,密歇根大学的Kin Fai Au教授走进良渚实验室,给大家带来了题为“New sequencing technology, new data analysis methods and new insights in transcriptomics and epigenetics”的精彩报告,报告由龚亮研究员主持。


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Kin Fai Au(区健辉)教授2004年本科毕业于清华大学,2009年于牛津大学获得博士学位,2009年至2013年在斯坦福大学师从美国科学院院士Wing H. Wong教授从事博士后研究,2013年加入爱荷华大学建立实验室,2018年任职于俄亥俄州立大学,2023年加入密歇根大学担任终身正教授。主要从事测序数据(尤其是长读长数据)的生物信息学方法开发,近年来在Nature Biotechnology、Nature Methods、Nature Structural & Molecular Biology等期刊发表了多篇高水平论文。


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Kin Fai Au教授深入介绍了第三代长读长测序在转录组和表观组领域中的技术优势和前沿应用。首先,由于二代测序读长普遍较短,为了定性和定量分析转录组的全貌(不同转录异构体、表达丰度),Au教授团队运用第三代测序开发了新的计算生物学算法,结合二代测序对长读长序列进行校正与定量,鉴定出了与细胞多能性相关的新转录本、新基因、以及重复元件相关的新转录事件。其次,为了在单分子水平研究染色质可及性和甲基化修饰,Au教授团队结合纳米孔测序和GpC甲基转移酶开发了MeSMLR-seq,利用该技术发现了酵母在不同浓度葡萄糖处理下,HXT6与HXT3基因启动子区域染色体开放程度呈现协同变化的新机制。最后,Au教授启发性介绍了三代测序在不同生物学层面的前沿研究,如RNA碱基修饰。

讲座后,Kin Fai Au教授与多位老师和学生进行了深入交流。


良渚学科交叉论坛

良渚学科交叉论坛是良渚实验室倾力打造的高水平、多学科交叉的学术交流平台,已有多位来自医工信不同领域的大咖开展了精彩纷呈的学术报告。良渚实验室坚持“四个面向”,积极营造有利于学科交叉的科研氛围和环境,集聚优势力量开展原创性引领性科技攻关,催生突破性、引领性科研成果,为加快实现高水平科技自立自强增力添彩。